«Музей Новосибирска» - это 8 филиалов в разных районах города.
Музей работает с посетителями как в стенах музея, так и за их пределами. Музей Новосибирска выходит в городское пространство и рассказывает историю города на пешеходных экскурсиях. Совместно с партнёрами снимаются фильмы, записываются и размещаются в свободном доступе аудиогиды (в том числе видеогид "Тихая Экскурсия" для слабослышащей категории населения), ведётся работа над значимыми проектами "Личность в истории", "Гордость Города", "Мемориал Славы Новосибирцев" "Город, который уходит" и т.д..
Сотрудники музея создают постоянные уличные выставки на шести площадках, открывают 10 выставок в метрополитене ежегодно.